- Forums - Ceviz Çeşitleri - dev cevizler Ceviz , Walnut , Juglans , Nut , Garella musculana , Erschoviella musculana , 
ceviz.biz :: Başlığı Görüntüle - Genomic variation among and within six Juglans species
 Pano KılavuzuPano Kılavuzu   AramaArama   GruplarGruplar   HesabınızHesabınız   Özel MesajlarÖzel Mesajlar   Giriş YapGiriş Yap 

Genomic variation among and within six Juglans species



 
Yeni Konu Gönder   Cevap Gönder    Mesaj Panosu -> Ceviz Çeşitleri
« Önceki konu :: Sonraki konu »  
Yazar Mesaj

Yeni Üye


Kayıt: Aug 25, 2013
İletiler: 4967
Şehir: istanbul
Durum: Çevirim Dışı
Tuttuğu Takım

Ruh Haliniz

Seviye:51
 
 
203 / 10164
4853 / 4853
137 / 280

İletiTarih: 20 Tem Cum, 2018 8:16 pm    İleti konusu: Genomic variation among and within six Juglans species Alıntıyla Cevap Gönder

Genomic variation among and within six Juglans species.
Kristian A. Stevens1,*, Keith Woeste4, Sandeep Chakraborty2, Marc W. Crepeau1, Charles A.
Leslie2, Pedro J. Martínez-García2
, Daniela Puiu3
, Jeanne Romero-Severson6
, Mark Coggeshall4
,
Abhaya M. Dandekar2, Daniel Kluepfel5
, David B. Neale2, Steven L. Salzberg3,7, and Charles H.
Langley1
1Department of Evolution and Ecology, University of California, Davis, Davis, CA
2Department of Plant Sciences University of California, Davis, CA
3
Center for Computational Biology, McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine, Johns
Hopkins University, Baltimore, MD
4 USDA Forest Service Hardwood Tree Improvement and Regeneration Center, Department of
Forestry and Natural Resources, Purdue University, West Lafayette, IN
5USDA Agricultural Research Station, Davis, CA
6Department of Biological Sciences, University of Notre Dame, Notre Dame, IN
7Departments of Biomedical Engineering, Computer Science, and Biostatistics, Johns Hopkins
University.
* Department of Evolution and Ecology, University of California, Davis, California 95616
Corresponding author: E-mail: kastevens@ucdavis.edu
ABSTRACT
Genomic analysis in Juglans (walnuts) is expected to transform the breeding and agricultural
production of both nuts and lumber. To that end, we report here the determination of reference
sequences for six additional relatives of Juglans regia: Juglans sigillata (also from section
Dioscaryon), Juglans nigra, Juglans microcarpa, Juglans hindsii (from section Rhysocaryon),
Juglans cathayensis (from section Cardiocaryon), and the closely related Pterocarya stenoptera.
While these are ‘draft’ genomes, ranging in size between 640Mbp and 990Mbp, their
contiguities and accuracies can support powerful annotations of genomic variation that are often
the foundation of new avenues of research and breeding. We annotated nucleotide divergence
and synteny by creating complete pairwise alignments of each reference genome to the
remaining six. In addition, we have re-sequenced a sample of accessions from four Juglans
species (including regia). The variation discovered in these surveys comprises a critical resource
for experimentation and breeding, as well as a solid complementary annotation. To demonstrate
the potential of these resources the structural and sequence variation in and around the
polyphenol oxidase loci, PPO1 and PPO2 were investigated. As reported for other seed crops
variation in this gene is implicated in the domestication of walnuts. The apparently Juglandaceae
specific PPO1 duplicate shows accelerated divergence and an excess of amino acid replacement
on the lineage leading to accessions of the domesticated nut crop species, Juglans regia and
sigillata.
Başa dön
Kullanıcı bilgilerini göster Özel mesaj gönder Kullanıcının web sitesini ziyaret et







Tuttuğu Takım

Ruh Haliniz

Seviye:
 
 

Tarih: 20 Tem Cum, 2018 8:16 pm    İleti konusu: Genomic variation among and within six Juglans species

Başa dön
İletileri göster:   
Yeni Konu Gönder   Cevap Gönder    Mesaj Panosu -> Ceviz Çeşitleri Saatler GMT +1 zaman dilimine göredir
1. sayfa (Toplam 1 sayfa)

 
Forum Seçin:  
Bu forumda yeni konular açamazsınız
Bu forumdaki iletilere cevap veremezsiniz
Bu forumdaki iletilerinizi değiştiremezsiniz
Bu forumdaki iletilerinizi silemezsiniz
Bu forumdaki anketlerde oy kullanamazsınız
Bu foruma eklenti dosyaları gönderemezsiniz
Bu forumdaki dosyaları indirebilirsiniz

Benzer Başlıklar
Konu Yazar Forum Cevap Tarih
Yeni ileti yok Juglans boliviana ceviz Ceviz Çeşitleri 1 12 Mar Sal, 2019 10:38 am Son gönderilen iletiler
Yeni ileti yok Juglans jamaicensis ceviz Ceviz Çeşitleri 2 01 Şub Cum, 2019 4:57 pm Son gönderilen iletiler
Yeni ileti yok Juglans venezulensis ceviz Ceviz Çeşitleri 0 01 Şub Cum, 2019 4:36 pm Son gönderilen iletiler
Yeni ileti yok Juglans steyermarkii ceviz Ceviz Çeşitleri 2 01 Şub Cum, 2019 4:30 pm Son gönderilen iletiler
Yeni ileti yok Juglans pyriformis ceviz Ceviz Çeşitleri 7 01 Şub Cum, 2019 10:33 am Son gönderilen iletiler

Etiketler : genomic variation among and within six juglans species

Powered by phpBB © 2001, 2005 phpBB Group & PNT Nuke
Site Düzenleme Vehbi Akdoğan (Web Coder)


Anasayfa |  Forumlar |  Videolar |  Sitene Haber Ekle |  Facebook |  Haber RSS |  İletişim |  SiteMap Map  GSS

Php-Nuke GPL Lisansı Altında Dağıtılan Ücretsiz Yazılımdır.